I filtri aria sterile vengono utilizzati in svariati modi nell'ambito della tecnologia lattiero-casearia, ma anche per altri processi sterili, come ad esempio in ambito farmaceutico. Si utilizzano ad esempio per aerare i sistemi di tubazioni una volta completata la sterilizzazione mediante calore umido, per aerare i contenitori e i serbatoi fra un livello di riempimento e l'altro oppure per la debatterizzazione di correnti laminari. Impediscono ai componenti impiantistici asettici di entrare a contatto dell'atmosfera contaminata. I filtri aria sterile si utilizzano fondamentalmente come interfacce tra un'area sterile e l'aria ambiente. Si tratta dunque di componenti ai quali occorre attribuire particolare importanza nell'ambito degli impianti sterili, poiché il loro funzionamento influisce notevolmente sulla qualità del prodotto. I punti deboli dei filtri aria sterile sono spesso riconducibili a un monitoraggio carente, alla contaminazione della condensa ma soprattutto a una durata troppo limitata.