Как и фасовка средних и больших объемов стерильных фармацевтических препаратов, например промывочной жидкости OP или заменителей крови, фасовка малых объемов предъявляет особые требования к фасовочному оборудованию. Самым частым вариантом является порционирование активных веществ: либо в лиофилизированной форме в закрытые крышками стеклянные сосуды, либо в жидком виде в стеклянные ампулы. В качестве содержимого чаще всего выступает активное вещество, лекарство для стабилизации циркуляции крови или вакцина.