Kaasunpesimiä voidaan käyttää erilaisilla väliaineilla. Vesipesussa puristettu biokaasu puhdistetaan vedellä. CO₂ sitoutetaan veteen fysikaalisesti (absorptio) ja toisessa kolonnissa se voidaan alhaisessa paineessa puolestaan vapauttaa (desorptio). Sen jälkeen vesi voidaan johtaa jälleen absorptiokolonniin. 

Fysikaalisessa kaasunpesussa voidaan veden ohella käyttää myös polyglykoleja. CO₂:n absorption jälkeen väliaine vastaavasti regeneroidaan, mikä tapahtuu useimmiten lämpötilaa nostamalla, ja ohjataan jäähdytyksen jälkeen takaisin absorptionkolonniin.

PSA-laitteistojen toimintaperiaate on adsorptio paineenvaihtelun avulla (Pressure Swing).

Ylipaineen siirtäminen rinnakkaisten adsorptiosäiliöiden välillä mahdollistaa järjestelmän jatkuvan toiminnan siten, että saavutetaan merkittävä energiansäästö. Biometaania tuotettaessa biokaasu virtaa puhdistussäiliöön. Tämä aiheuttaa CO₂:n selektiivisen adsorboitumisen molekyyliseuloihin. Puhdistettu biometaani virtaa ulos. Toinen säiliö regeneroidaan (paineenpoisto ja huuhtelu) ja CO₂ vapautetaan ympäristöön. Molempia absorptiosäiliöitä käytetään vuorotellen jatkuvan toiminnan varmistamiseksi. Kun toisessa säiliössä on käynnissä absorptiovaihe, toista säiliötä regeneroidaan. Sorptiojakson alkua edeltää paineenvaihto. Paineen alainen kaasu siirretään kyllästetystä säiliöstä regeneroituun säiliöön.

Polymeerikalvojen avulla tapahtuvassa kaasunkäsittelyssä hyödynnetään kaasujen erilaisia permeaatio-ominaisuuksia.

CO₂ ja H₂S läpäisevät kalvot biometaania helpommin, ja ne voidaan siten johtaa pois. Tuloksena syntyy erittäin puhdasta biometaania.